/usr/lib/R/site-library/geneplotter/doc/byChroms.R is in r-bioc-geneplotter 1.56.0-1.
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### code chunk number 1: loaddata
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library("annotate")
library("hu6800.db")
lens <- unlist(eapply(hu6800CHR, length))
table(lens)
wh2 = mget(names(lens)[lens==2], env = hu6800CHR)
wh2[1]
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### code chunk number 2: fixdata
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chrs2 <- unlist(eapply(hu6800CHR, function(x) x[1]))
chrs2 <- factor(chrs2)
length(chrs2)
table(unlist(chrs2))
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### code chunk number 3: strandloc
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strand <- as.list(hu6800CHRLOC)
splits <- split(strand, chrs2)
length(splits)
names(splits)
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### code chunk number 4: chrloc
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newChrClass <- buildChromLocation("hu6800")
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### code chunk number 5: cPlot
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library(geneplotter)
cPlot(newChrClass)
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