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<title>fr:manuals:freediams:command_line</title>
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</head>
<body>
<div class="dokuwiki export">
<!-- TOC START -->
<div class="toc">
<div class="tocheader toctoggle" id="toc__header">Table des matières</div>
<div id="toc__inside">
<ul class="toc">
<li class="level1"><div class="li"><span class="li"><a href="#connection_a_un_gestionnaire_de_dossiers_externe" class="toc">Connection à un gestionnaire de dossiers externe</a></span></div>
<ul class="toc">
<li class="level2"><div class="li"><span class="li"><a href="#utilisation_de_la_ligne_de_commande" class="toc">Utilisation de la ligne de commande</a></span></div>
<ul class="toc">
<li class="level3"><div class="li"><span class="li"><a href="#parametres_de_la_ligne_de_commande" class="toc">Paramètres de la ligne de commande</a></span></div></li>
<li class="level3"><div class="li"><span class="li"><a href="#examples" class="toc">Examples</a></span></div></li>
</ul>
</li>
<li class="level2"><div class="li"><span class="li"><a href="#les_fichiers_d_echange_de_donnees" class="toc">Les fichiers d'échange de données</a></span></div>
<ul class="toc">
<li class="level3"><div class="li"><span class="li"><a href="#le_fichier_d_echange_entrant" class="toc">Le fichier d'échange entrant</a></span></div></li>
<li class="level3"><div class="li"><span class="li"><a href="#structuration_xml_du_fichier_d_echange_entrant" class="toc">Structuration XML du fichier d'échange entrant</a></span></div></li>
<li class="level3"><div class="li"><span class="li"><a href="#valeurs_par_defaut" class="toc">Valeurs par défaut</a></span></div></li>
</ul>
</li>
<li class="level2"><div class="li"><span class="li"><a href="#le_fichier_d_echange_sortant" class="toc">Le fichier d'échange sortant</a></span></div>
<ul class="toc">
<li class="level3"><div class="li"><span class="li"><a href="#format_de_fichier" class="toc">Format de fichier</a></span></div></li></ul>
</li></ul>
</li></ul>
</div>
</div>
<!-- TOC END -->
<div class="tags"><span>
<a href="fr/freediams?tag=fr:freediams" class="wikilink1" title="fr:freediams" rel="tag">freediams</a>,
<a href="fr/usermanual?tag=fr:usermanual" class="wikilink1" title="fr:usermanual" rel="tag">usermanual</a>,
<a href="tag/updated?tag=updated" class="wikilink1" title="tag:updated" rel="tag">updated</a>
</span></div>
<h1 class="sectionedit1"><a name="connection_a_un_gestionnaire_de_dossiers_externe" id="connection_a_un_gestionnaire_de_dossiers_externe">Connection à un gestionnaire de dossiers externe</a></h1>
<div class="level1">
<p>
<p><div class="notedoc">This page is up-to-date.
</div></p>
</p>
</div>
<!-- EDIT1 SECTION "Connection à un gestionnaire de dossiers externe" [44-152] -->
<h2 class="sectionedit2"><a name="utilisation_de_la_ligne_de_commande" id="utilisation_de_la_ligne_de_commande">Utilisation de la ligne de commande</a></h2>
<div class="level2">
<p>
FreeDiams est pensé comme un “module” externe. Ce “module” peut étre utilisé par un grand nombre de logiciel propriétaires ou non. A l'heure actuel, MedinTux et GNUMed sont configurables pour utiliser ce logiciel comme prescripteur.
</p>
<p>
Pour interfacer un logiciel avec FreeDiams, il suffit de renseigner les paramètres de la ligne de commande et d'utiliser les fichiers d'échange.
</p>
</div>
<!-- EDIT2 SECTION "Utilisation de la ligne de commande" [153-588] -->
<h3 class="sectionedit3"><a name="parametres_de_la_ligne_de_commande" id="parametres_de_la_ligne_de_commande">Paramètres de la ligne de commande</a></h3>
<div class="level3">
<p>
Dans la plupart des cas, il est recommandé de transmettre les données à FreeDiams en utilisant le fichier d'échange entrant plutôt que d'utiliser la ligne de commande (cf infra).
</p>
<p>
Vous pouvez à tous moment vérifier les paramètres transmis (par la ligne de commande ou par le fichier entrant) grâce au dialogue <strong>À propos/Application/Ligne de commande</strong>.
</p>
</div>
<h4><a name="parametres_concernant_l_interface_utilisateur_de_freediams" id="parametres_concernant_l_interface_utilisateur_de_freediams">Paramètres concernant l'interface utilisateur de FreeDiams</a></h4>
<div class="level4">
<ul>
<li class="level1"><div class="li"> –version , -version , -v : affiche la version actuelle de FreeDiams.</div>
</li>
<li class="level1"><div class="li"> –selection-only : Démarre FreeDiams en mode de sélection seulement.</div>
</li>
<li class="level1"><div class="li"> –chrono : Chronomètres diverses fonctions du testeur d'interactions (proposé à des fins de déboggage)</div>
</li>
<li class="level1"><div class="li"> –blockpatientdatas : Empêcher la modification des données patients dès l'ouverture</div>
</li>
<li class="level1"><div class="li"> –drugsdb-uid : Identifiant unique spéficique à FreeDiams pour la base de données thérapeutiques à utiliser à l'ouverture</div>
</li>
</ul>
</div>
<h4><a name="parametres_pour_les_fichiers_d_echange" id="parametres_pour_les_fichiers_d_echange">Paramètres pour les fichiers d'échange</a></h4>
<div class="level4">
<ul>
<li class="level1"><div class="li"> –medintux : définit une utilisation spécifique à MedinTux.</div>
</li>
<li class="level1"><div class="li"> –exchange-in=”/path/to/xml/exchange-in.xml” : définit le fichier d'échange entrant.</div>
</li>
<li class="level1"><div class="li"> –exchange-out=”/path/to/file.xch” : définit le fichier que FreeDiams va écrire, selon de propre droits de chemin d'accès.</div>
</li>
<li class="level1"><div class="li"> –exchange-format=“xml html html_xml” : format du fichier d'échange de sortie (choisir un format)</div>
</li>
</ul>
</div>
<h4><a name="parametres_utiles_pour_les_gestionnaires_de_dossiers_medicaux_externes" id="parametres_utiles_pour_les_gestionnaires_de_dossiers_medicaux_externes">Paramètres utiles pour les gestionnaires de dossiers médicaux externes</a></h4>
<div class="level4">
<ul>
<li class="level1"><div class="li"> –emr-name : nom du gestionnaire de dossiers médicaux appelant (sera inclus dans le file d'échange sortant sans modification)</div>
</li>
<li class="level1"><div class="li"> –emr-uid : session UID du gestionnaire externe (sera inclus dans le fichier d'échange sortant sans modifications)</div>
</li>
</ul>
</div>
<h4><a name="parametres_utilises_pour_transmettre_les_donnees_patient" id="parametres_utilises_pour_transmettre_les_donnees_patient">Paramètres utilisés pour transmettre les données patient</a></h4>
<div class="level4">
<ul>
<li class="level1"><div class="li"> <strong>Identité :</strong></div>
<ul>
<li class="level2"><div class="li"> –patientuid : UID du patient (sera inclus dans le file d'échange sortant sans modification)</div>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> –patientname=“xx xx xx” : définit le nom du patient.</div>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> –patientfirstname=“xx xx” : définit le prénom du patient.</div>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> –gender=M : définit le sexe (peut-être égal à 'M' pour Masculin, 'F' Feminin, 'H' Hermaphrodisme)</div>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> –dateofbirth=“yyyy/MM/dd” : définit la data de naissance du patient</div>
</li>
</ul>
</li>
</ul>
<ul>
<li class="level1"><div class="li"> <strong>Données physiologiques :</strong></div>
<ul>
<li class="level2"><div class="li"> –weight=“dd” : définit le poids du patient (en kg)</div>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> –weight-unit : Unité de mesure du poids : Kg/lbs</div>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> –height=“ddd” : définit la taille du patient</div>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> –height-unit : Unité de mesure de la taille : cm/inches</div>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> –crcl=“dd.d” : définit la clairance de la créatinine du patient</div>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> –crcl-unit : Unité de mesure de la clearance de créatinine</div>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> –creatinine=“dd” : définit la créatininémie du patient (en mg/l)</div>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> –creatinine-unit : Unité de mesure de la créatinine :(mg/l or mmol/l)</div>
</li>
</ul>
</li>
</ul>
<ul>
<li class="level1"><div class="li"> <strong>Précautions à la prescription :</strong> (allergies et intolérances médicamenteuses connues)</div>
<ul>
<li class="level2"><div class="li"> <strong>Allergies :</strong></div>
<ul>
<li class="level3"><div class="li"> –drugs-uid-allergies : Liste des UID des médicaments pour lesquels une allergie est connue (séparer les valeurs par un point virgule)</div>
</li>
<li class="level3"><div class="li"> –atc-allergies : liste des codes ATC pour lesquels une allergie est connue (séparer les valeurs par un point virgule)</div>
</li>
<li class="level3"><div class="li"> –inn-allergies : Liste des libellés DCI pour lesquels une allergie est connue (séparer les valeurs par un point virgule - les libellés doivent ceux de la table ATC connue de FreeDiams)</div>
</li>
</ul>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> <strong>Intolérances : </strong></div>
<ul>
<li class="level3"><div class="li"> –drugs-uid-intolerances : Liste des UID des médicaments pour lesquels une intolérance est connue (séparer les valeurs par un point virgule)</div>
</li>
<li class="level3"><div class="li"> –inn-intolerances : Liste des libellés DCI pour lesquels une intolerance est connue (séparer les valeurs par un point virgule - les libellés doivent ceux de la table ATC connue de FreeDiams)</div>
</li>
<li class="level3"><div class="li"> -atc-intolerances : liste des codes ATC pour lesquels une intolerance est connue (séparer les valeurs par un point virgule)</div>
</li>
</ul>
</li>
</ul>
</li>
</ul>
</div>
<h4><a name="parametres_utiles_pour_les_participants_au_projet_freemedforms" id="parametres_utiles_pour_les_participants_au_projet_freemedforms">Paramètres utiles pour les participants au projet FreeMedForms</a></h4>
<div class="level4">
<ul>
<li class="level1"><div class="li"> –transmit-dosage = réservé aux membres du comité scientifique. Permet de transmettre tous les protocoles enregistrés au serveur de données.</div>
</li>
</ul>
</div>
<!-- EDIT3 SECTION "Paramètres de la ligne de commande" [589-4726] -->
<h3 class="sectionedit4"><a name="examples" id="examples">Examples</a></h3>
<div class="level3">
<ul>
<li class="level1"><div class="li"> Linux/*BSD :</div>
</li>
</ul>
<pre class="code"> freediams --exchange-in="/home/me/exchange-in.xml"</pre>
<ul>
<li class="level1"><div class="li"> Win :</div>
</li>
</ul>
<pre class="code"> freediams.exe --exchange-in="c:\Files\exchangein.xml"</pre>
<ul>
<li class="level1"><div class="li"> Mac (don't forget the bundle) :</div>
</li>
</ul>
<pre class="code"> FreeDiams.app/Contents/MacOs/FreeDiams --exchange-in="/Users/me/exchange-in.xml"</pre>
</div>
<!-- EDIT4 SECTION "Examples" [4727-5018] -->
<h2 class="sectionedit5"><a name="les_fichiers_d_echange_de_donnees" id="les_fichiers_d_echange_de_donnees">Les fichiers d'échange de données</a></h2>
<div class="level2">
</div>
<!-- EDIT5 SECTION "Les fichiers d'échange de données" [5019-5067] -->
<h3 class="sectionedit6"><a name="le_fichier_d_echange_entrant" id="le_fichier_d_echange_entrant">Le fichier d'échange entrant</a></h3>
<div class="level3">
<p>
Tous les fichiers sont encodés en UTF-8.<br/>
Il est préférable d'utiliser les fichiers d'échanges à la ligne de commande pour renseigner les différents paramètres à utiliser dans FreeDiams.<br/>
Lorsqu'un fichier d'échange entrant est spécifié les données qu'ils incluent remplacent les données passés en ligne de commande. Une utilisation mixte est toujours possible : une partie des données sont transmises par la ligne de commande, l'autre par le fichier d'échange entrant.<br/>
La structure de ce fichier doit répondre aux exigences ci-dessous.
</p>
</div>
<!-- EDIT6 SECTION "Le fichier d'échange entrant" [5068-5668] -->
<h3 class="sectionedit7"><a name="structuration_xml_du_fichier_d_echange_entrant" id="structuration_xml_du_fichier_d_echange_entrant">Structuration XML du fichier d'échange entrant</a></h3>
<div class="level3">
</div>
<div class="plugin_include_content" id="plugin_include__common:manuals:freediams:exchangeinfile">
<pre class="code xml"><span class="sc3"><span class="re1"><FreeDiams_In</span> <span class="re0">version</span>=<span class="st0">"0.5.0"</span><span class="re2">></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><ConfigFile</span> <span class="re0">value</span>=<span class="st0">"/absolute/file/specification/to/the/required/configFile.ini"</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><ExchangeOut</span> <span class="re0">value</span>=<span class="st0">"/absolute/file/specification/to/the/required/exchange_File.txt"</span> <span class="re0">format</span>=<span class="st0">"xml html html_xml"</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><DrugsDatabase</span> <span class="re0">uid</span>=<span class="st0">"FREEDIAMS_DRUGS_DATABASE_UID"</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><EMR</span> <span class="re0">name</span>=<span class="st0">"NameWillBeShownInTheMainWindowTitle"</span> <span class="re0">uid</span>=<span class="st0">"SessionUIDWillBeReturnedInOutputFile"</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><Patient<span class="re2">></span></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><Identity</span> <span class="re0">lastnames</span>=<span class="st0">"Family or equivalent name e.g. Kirk"</span></span>
<span class="sc3"> <span class="re0">firstnames</span>=<span class="st0">"James Tiberius"</span></span>
<span class="sc3"> <span class="re0">uid</span>=<span class="st0">"EMR Patient's UID"</span></span>
<span class="sc3"> <span class="re0">dob</span>=<span class="st0">"yyyy/MM/dd"</span></span>
<span class="sc3"> <span class="re0">gender</span>=<span class="st0">"M or F or H"</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><Creatinine</span> <span class="re0">value</span>=<span class="st0">"12"</span> <span class="re0">unit</span>=<span class="st0">"mg/l or mmol/l"</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><Weight</span> <span class="re0">value</span>=<span class="st0">"70"</span> <span class="re0">unit</span>=<span class="st0">"kg or lbs"</span> <span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><Height</span> <span class="re0">value</span>=<span class="st0">"170"</span> <span class="re0">unit</span>=<span class="st0">"cm or "</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><InnAllergies</span> <span class="re0">value</span>=<span class="st0">"inn1;inn2;inn3"</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><ATCAllergies</span> <span class="re0">value</span>=<span class="st0">"ATC1;ATC2;ATC3"</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><DrugsUidAllergies</span> <span class="re0">value</span>=<span class="st0">"7655668;876769;656789"</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><InnIntolerances</span> <span class="re0">value</span>=<span class="st0">"inn1;inn2;inn3"</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><ATCIntolerances</span> <span class="re0">value</span>=<span class="st0">"ATC1;ATC2;ATC3"</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><DrugsUidIntolerances</span> <span class="re0">value</span>=<span class="st0">"7655668;876769;656789"</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><ICD10</span> <span class="re0">value</span>=<span class="st0">"J11.0;A22;Z23"</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"></Patient<span class="re2">></span></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"><Ui</span> <span class="re0">editmode</span>=<span class="st0">"select-only or prescriber"</span> <span class="re0">blockPatientDatas</span>=<span class="st0">"0/1"</span><span class="re2">/></span></span>
<span class="sc3"><span class="re1"></FreeDiams_In<span class="re2">></span></span></span></pre>
<p>
<p><div class="noteclassic">
FreeDiams will “read-only” this <acronym title="Extensible Markup Language">XML</acronym> file for patient and allergy/intolerance data. If an “ExchangeOut” file is specified, FreeDiams will read it <strong>only</strong> for prescription data (ignoring patient data). On close, FreeDiams will write the currently edited prescription to the “ExchangeOut” file, so that EMR can retreive information.
</div></p>
</p>
<p>
<p><div class="noteimportant">
<strong>Please note the difference between relative and absolute path.</strong>
</p>
<ul>
<li class="level1"><div class="li"> absolute path starts with <em>'/'</em> or <em>'X:\\'</em></div>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> relative path starts with <em>'./'</em> or <em>'../'</em></div>
</li>
</ul>
<p>
The relative path are calculated from the application's binary. They should be different for each <acronym title="Operating System">OS</acronym>:
</p>
<ul>
<li class="level1"><div class="li"> under Linux, the binary is installed in <em> /usr/bin </em></div>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> under MacOs, binary is inside the Bundle <em> /Path/To/Application.app/Contents/MacOs </em></div>
</li>
<li class="level2"><div class="li"> under Windows, binary is installed in <em>C:\\Path\\To\FreeDiams </em></div>
</li>
</ul>
<p>
It is recommended to use absolute full path inside the <acronym title="Extensible Markup Language">XML</acronym> exhange-in file, so that the calls to FreeDiams will be fully multi-<acronym title="Operating System">OS</acronym>.
</div></p>
</p>
<p>
<p><div class="notetip">When passing ATC codes for allergies or intolerances, you can pass <em>Class ATC Codes</em> which are less than 7 char length.
</div></p>
</p>
<div class="inclmeta level">
<abbr class="published" title="2010-09-27T12:09:11Z">2010/09/27 12:09</abbr>
</div>
</div>
<div class="level3">
</div>
<!-- EDIT7 SECTION "Structuration XML du fichier d'échange entrant" [5669-5779] -->
<h3 class="sectionedit8"><a name="valeurs_par_defaut" id="valeurs_par_defaut">Valeurs par défaut</a></h3>
<div class="level3">
<ul>
<li class="level1"><div class="li"> <em>–exchange-format</em> = <em>html_xml</em></div>
</li>
<li class="level1"><div class="li"> <em>Ui</em> = prescriber</div>
</li>
<li class="level1"><div class="li"> <em>BlockPatientDatas</em> = 0</div>
</li>
<li class="level1"><div class="li"> <em>ConfigFile</em> = the default one (in your home path)</div>
</li>
</ul>
</div>
<!-- EDIT8 SECTION "Valeurs par défaut" [5780-5962] -->
<h2 class="sectionedit9"><a name="le_fichier_d_echange_sortant" id="le_fichier_d_echange_sortant">Le fichier d'échange sortant</a></h2>
<div class="level2">
<p>
Lorsqu'un fichier d'échange est notifié, FreeDiams essaie de lire le contenu de ce fichier et d'y récupérer les données de la prescription. <br/>
A la fermeture de l'application, la prescription est sauvegardée dans le d'échange sous format <acronym title="Extensible Markup Language">XML</acronym>, sans intervention de l'utilisateur (inutile de sauvegarder avant de quitter l'application). <br/>
Lorsque le paramètre –medintux est notifié dans la ligne de commande, le format du fichier d'échange est spécifique à MedinTux.
</p>
<p>
Le contenu du fichier d'échange de sortie est un mélange d'<acronym title="HyperText Markup Language">HTML</acronym> et de <acronym title="Extensible Markup Language">XML</acronym>.
</p>
</div>
<!-- EDIT9 SECTION "Le fichier d'échange sortant" [5963-6563] -->
<h3 class="sectionedit10"><a name="format_de_fichier" id="format_de_fichier">Format de fichier</a></h3>
<div class="level3">
</div>
<h4><a name="formathtml_xml" id="formathtml_xml">Format: html_xml</a></h4>
<div class="level4">
<p>
Jusqu'à la version v0.4.0, le fichier est structuré de la sorte.
</p>
<pre class="code html4strict"><span class="sc2"><<a href="http://december.com/html/4/element/html.html"><span class="kw2">html</span></a>></span>
...
<span class="sc2"><<a href="http://december.com/html/4/element/body.html"><span class="kw2">body</span></a>></span>
<span class="sc2"><<a href="http://december.com/html/4/element/a.html"><span class="kw2">a</span></a> <span class="kw3">href</span><span class="sy0">=</span><span class="st0">"FreeDiamsEncodedPrescription:base64FreeDiamsXmlencoded"</span>></span>
... (full HTML prescription)
<span class="sc2"><<span class="sy0">/</span><a href="http://december.com/html/4/element/a.html"><span class="kw2">a</span></a>></span>
<span class="sc2"><<span class="sy0">/</span><a href="http://december.com/html/4/element/body.html"><span class="kw2">body</span></a>></span>
<span class="sc2"><<span class="sy0">/</span><a href="http://december.com/html/4/element/html.html"><span class="kw2">html</span></a>></span></pre>
<p>
Pour les versions à partir de la 0.4.0 :
</p>
<pre class="code html4strict"><span class="sc2"><<a href="http://december.com/html/4/element/html.html"><span class="kw2">html</span></a>></span>
...
<span class="sc2"><<a href="http://december.com/html/4/element/meta.html"><span class="kw2">meta</span></a> <span class="kw3">name</span><span class="sy0">=</span><span class="st0">"FreeDiams"</span> <span class="kw3">content</span><span class="sy0">=</span><span class="st0">"FreeDiamsEncodedPrescription:base64FreeDiamsXmlencoded"</span><span class="sy0">/</span>></span>
<span class="sc2"><<a href="http://december.com/html/4/element/body.html"><span class="kw2">body</span></a>></span>
... (full HTML prescription)
<span class="sc2"><<span class="sy0">/</span><a href="http://december.com/html/4/element/body.html"><span class="kw2">body</span></a>></span>
<span class="sc2"><<span class="sy0">/</span><a href="http://december.com/html/4/element/html.html"><span class="kw2">html</span></a>></span></pre>
</div>
<h4><a name="formatxml" id="formatxml">Format: xml</a></h4>
<div class="level4">
<p>
Le code <acronym title="Extensible Markup Language">XML</acronym> correspond à celui décrit <a href="prescription_io.html" class="wikilink1" title="fr:manuals:freediams:prescription_io">dans le chapitre suivant</a>.
</p>
</div>
<!-- EDIT10 SECTION "Format de fichier" [6564-] --></div>
</body>
</html>
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